この世には、科学では説明のつかない現象が存在しそうであるが、実はほとんどない。あったとしても、忙しい科学者たちはそんな下らない現象を研究する気にもならない。これらをFBl(エフ・ビー・エル)が適当に保管している。それがX(ペケ)ファイルである。エフ・ビー・エルとは何の略なのか?エルはもしかするとLittle Mustaphaのエルかも知れない。数々の謎がFBl捜査官を待ち受ける。この謎を解明したとしてもそこに何かの意味があるとは思えない。